Las especies que se encuentran en un hábitat interaccionan entre ellas de formas muy diversas, desde el consumo de un organismo por parte de otro (como la herbivoría, la depredación o el parasitismo) a relaciones mutualistas (como la polinización o la dispersión de semillas). Estas interacciones forman redes que pueden llegar a ser muy complejas y generar otras interacciones indirectas, como las que se dan cuando dos especies compiten por un mismo recurso, o cuando una especie favorece a otra consumiendo uno de sus depredadores. Analizar la estructura de estas interacciones es fundamental para comprender la dinámica de las poblaciones y el funcionamiento de los ecosistemas. En el contexto actual de pérdida de biodiversidad, es importante tener presente que algunas interacciones pueden desaparecer antes de que lo hagan las especies involucradas en la interacción. En este contexto, uno de los retos del CREAF es analizar la estructura y la robustez de las redes de interacciones frente a diferentes factores de cambio global (como el cambio climático, los cambios de usos del suelo, la intensificación agropecuaria o las invasiones biológicas). Estudiamos los efectos de estos factores sobre varios tipos de redes tróficas (como las de organismos del suelo, ecosistemas de montaña, o sistemas lacustres) y de relaciones (como la dispersión de semillas o la polinización), así como sus implicaciones funcionales (como los ciclos biogeoquímicos, la expansión de los bosques o la producción de frutos y semillas).
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