En la dinámica de los ecosistemas intervienen muchas especies con ciclos vitales de duración diferente, desde unas pocas horas hasta decenas de años. Una opción de investigación es diseccionar algunos de los principales procesos que intervienen en la dinámica general y extraer principios generales. Estos datos después podrán combinarse en simulaciones y hacer proyecciones y análisis de hacia dónde irá la dinámica de los sistemas a medio y largo plazo. Sin embargo, a medida que se combinan más procesos, la dificultad de predicción aumenta. Y lo hace aún más si el ecosistema se encuentra inmerso en un cambio de las condiciones de su entorno, como actualmente sucede con el cambio global y su proyección regional. Por ello, una vía complementaria de investigación, de carácter más holístico, se fundamenta en el seguimiento de la dinámica del ecosistema mediante la observación y la caracterización. Los objetivos del seguimiento son diagnosticar lo que ecológicamente puede estar pasando en un lugar, comparar lugares del territorio y del conjunto del planeta, proyectar el futuro inmediato y alimentar y validar modelos que aspiran a entender y reproducir la dinámica a medio y largo plazo del ecosistema.
Las principales líneas de trabajo y experiencia del CREAF en este campo incluyen:
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